1999年罕見疾病及孤兒藥問題開始受到各界的重視，並於2000年元月立法通過「罕見疾病防治及藥物法」，清楚建構孤兒藥的申請流程以及獎勵事項。並又在2001年於中國醫藥大學附設醫院成立「罕病藥物物流中心」，使得原本乏人問津的罕病孤兒藥獲得重視與鼓勵，也大大解決罕病患者用藥的問題。
經由主辦單位精心設計，「第三屆罕見疾病藥物供應、研發及製造頒獎典禮」於七月二十三日隆重舉行，當日由衛生署署長陳建仁代表歡迎及感謝所有得獎者，並鼓勵有更多藥廠以及醫師能夠投入罕見疾病的藥物研發、引進以及個案通報的行列。期待使病患的就醫問題能夠獲得更妥善及立即的協助。已落實罕病法的立法精神。得獎名單：
壹、罕見疾病藥物供應製造及研究發展獎
1.傑出貢獻獎：中國醫藥大學附設醫院 蔡輔仁醫師
2.貢獻獎：馬偕紀念醫院 林炫沛醫師
吉帝藥品股份有限公司
3.服務獎：行政院衛生署疾病管制局
信東生技股份有限公司
4.特殊貢獻獎：中研院生醫所 陳垣崇所長
貳、九十二年度罕見疾病個案報告績優獎（績優醫療機構）
1.第一名：中國醫藥大學附設醫院
2.第二名：國立台灣大學醫學院附設醫院
3.第三名：馬偕紀念醫院
4.嘉 獎：長庚紀念醫院兒童分院
台中榮民總醫院
高雄醫學大學附設醫院
參、九十二年度罕見疾病個案報告績優獎（績優醫事人員）
1.第一名：中國醫藥大學附設醫院 蔡輔仁醫師
2.第二名：馬偕紀念醫院 林炫沛醫師
3.第三名：國立台灣大學醫學院附設醫院 胡務亮醫師
4.嘉 獎：長庚紀念醫院兒童分院 林如立醫師
台中榮民總醫院 徐山靜醫師
高雄醫學大學附設醫院 趙美琴醫師
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